מערות צפון:

 

החרמון והגולן

הגליל העליון המזרחי ועמק החולה

מרום הגליל ואיזור הר מירון

הגליל העליון המערבי

הגליל התחתון

הכרמל וחופו, רמות מנשה

 

מערות מרכז:

 

השומרון והגלבוע 

חבל בנימין

הרי ירושלים ('פרוזדור')

דרום הרי יהודה

צפון השפלה ומישור החוף

שפלת יהודה

 

מערות דרום:

 

צפון מדבר יהודה

דרום מדבר יהודה

הר סדום

הנגב